Агдамский центр мугама был построен по инициативе Фонда Гейдара Алиева в 2018 году, и 5 ноября того же года Президент Азербайджанской Республики Ильхам Алиев и первая леди, президент Фонда Гейдара Алиева Мехрибан Алиева приняли участие в открытии Центра мугама.

Строительство центра началось в октябре 2016 года. Работы по строительству и проектированию заняли около 2 лет.

Площадь Центра мугама составляет 7 782 квадратных метра, а площадь под застройку - 1800 квадратных метров. В двухэтажном здании созданы концертный зал на 328 мест, гримерные, зал ожидания, технические, административные, вспомогательные и другие помещения. В центре также есть мастерская по ремонту музыкальных инструментов. В классных комнатах центра есть все возможности для овладения секретами мугама.

Территория, на которой расположен Агдамский центр мугама, благоустроена, на площади 0,6 га создан парк отдыха, проложена зеленая полоса, посажены кусты роз, установлена система освещения.

Компания ООО Palıd также сыграла роль в строительстве центра. Так работы по МДФ, используемые в интерьере и экстерьере центра, были поручены компании ООО Palıd.